孤独症需要与其他的广泛性发育障碍以及其他儿童常见精神神经疾病进行鉴别
１． 阿斯伯格综合征（ａｓ）阿斯伯格综合征是广泛性发育障碍的一种类型患儿有社会交流障碍和重复刻板行为但是在语言和认知能力方面发育正常而且多数ａｓ儿童可能在认知的某些方面表现为超常尤其是对文字地图统计表和火车时刻表的记忆方面语言能力尽管正常但是仍然可以发现ａｓ儿童口头语言存在异常给人感觉为语言迂腐和过于正式而显得象卖弄文字动作笨拙是ａｓ的一个特征在学校难于和同学建立友谊关系通常仅仅在学龄期才被发现较容易与高功能孤独症混淆鉴别要点是高功能孤独症儿童存在语言发育迟缓而ａｓ儿童没有明显的语言发育落后现象
２． 广泛性发育障碍未注明（ｐｄｄ－ｎｏｓ） 该诊断通常用于诊断那些轻型或不典型孤独症
３． ｒｅｔｔ综合征 ｒｅｔｔ综合征仅见于女孩患儿在早期发育正常在大约６－２４个月左右起病病情发展通常经历四个阶段早期起病停滞阶段（６－１８月）快速倒退阶段（１－４岁）假性停滞阶段（学前－学龄早期）和晚期运动衰退阶段（５－１５岁）在第一和第二阶段出现孤独症样表现包括语言功能的丧失特征性的手部刻板＂洗手＂动作智力显著倒退和过度通气但是该病患儿在第三四阶段表现有较为明显的神经系统症状和体征例如肌张力减低躯干共济失调和失用脊柱侧突和后突重症患儿出现强直状态多数病例伴有癫痫发作据此可与孤独症鉴别
４． 儿童瓦解性精神障碍 瓦解性精神障碍又称婴儿痴呆或ｈｅｌｌｅｒ综合征患儿在至少两岁以前发育正常之后出现明显而迅速的语言社交游戏和适应能力倒退大小便失禁等早期发病者与孤独症的鉴别相当困难
５． 儿童精神发育迟滞（ｍｒ） 部分ｍｒ儿童可以表现有孤独症样症状多数孤独症儿童亦表现精神发育迟滞可以根据孤独症儿童的社交障碍行为特征以及部分特别认知能力加以鉴别
６． 儿童精神分裂症 孤独症儿童的某些行为方式类似精神分裂症但是孤独症儿童不存在妄想和幻觉鉴别不难
７． 其他需要与孤独症鉴别的疾病还有注意缺陷多动障碍严重学习障碍选择性缄默症感受性语言发育障碍等
