肺脓肿的及时，完全愈合需足够抗生素治疗。大多数病人可恢复，不需手术。
一旦痰液和血液标本被收集用以作培养和药敏后，即可开始抗生素治疗。首选克林霉素，开始剂量为600mg静滴，每日3次，然后300mg口服，每日4次。亦可选用青霉素g静滴，200万~1000万u/d，随后给予青霉素ⅴ口服500~750mg，每日4次。当病人热退以及客观症状改善后，抗生素改为口服。有些专家选用青霉素和甲硝唑500mg口服，每日4次，联合用药。如果由革兰氏阴性杆菌，金黄色葡萄球菌或其他需氧菌引起，抗生素的选择可根据药敏试验。治疗应持续到肺炎消散和空洞消失，仅有小的稳定的残余病灶，壁薄的囊或肺野清晰。病灶消散通常需数周至数月的治疗，大多数病人出院后仍需口服抗生素。
体位引流可为有效辅助方法，但也可以导致脓液流医学教育网。收集，整理入其他支气管引起病变扩散或急性阻塞。如果病人虚弱或麻痹，需气管切开和吸引。偶尔，支气管镜有助引流。因病灶常对抗生素有效，故极少需要外科引流。大空洞药物治疗无效的病人可作皮下引流，脓胸病人也需要引流。
肺切除用于脓肿对药物耐药，特别是疑有支气管癌时。肺叶切除最常用，段切除用于小病灶。肺切除用于多发性脓肿或难治性肺坏疽。肺切除后的死亡率为5%~10%，切除范围较小的，死亡率更低。
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