种乙肝疫苗重点应用人群应是新生儿、学龄前儿童，尤其是母亲在妊娠期间为病毒携带者的新生儿。另一危险人群，包括乙肝病人和乙肝病毒携带者的配偶，家庭成员或密切接触者，接触乙肝病人的医护人员等。
接种乙肝疫苗前一定要检查乙型肝炎病毒表面抗原(hbsag)、表面抗体(抗-hbs)和核心抗体(抗- hbc)，也就是常话的乙肝“两对半”，当化验结果出来时，根据结果来决定是否进行接种疫苗，比如，阴性者就必须注射，表面抗体(抗-hbs)阳性者就不须注射，因为他（她）体内已经产生抗体；另外，两岁以内的小儿如没有密切接触史，可以不用化验，直接注射乙肝疫苗。
接种了乙肝疫苗后，一般只能维持3～5年，以后必须在医生指导下再加强注射。注射乙肝疫苗后所产生的抗体只能预防乙肝病毒感染和乙肝发病。对其它类型的病毒性肝炎没有预防作用。接种者还可能感染甲、丙、戊、庚肝等病毒。
有条件的妇女可以在婚前接种乙肝疫苗。婚前接种不排斥新生儿出生后接受常规接种。两者结合更佳。妇女婚前接种乙肝疫苗有利于阻断“母一婴”或“父一婴”传播途径。注射疫苗后的未来的母亲可将通过接种所产生的对乙肝病毒的免疫力直接传递给胎儿，如果她们的丈夫感染了乙肝病毒，则通过接种在体内所产生的抗-hbs可以抵抗丈夫精液中进入的乙肝病毒，保护卵细胞和受精卵不被感染。
乙肝疫苗接种的具体办法是：在婴儿出生2天内(48小时)注射第一针；满1个月时注射第二针；满6个月时注射第三针。这三针打完后，有效预防时间在5年左右。孩子长到5周岁，仍按上述办法再打3针。
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