一、感染源不同。流行性感冒是由流感病毒引起的。普通感冒是鼻病毒所致，此外还有副流感病毒、冠状病毒、腺病毒等引起，又可因不良气体刺激上呼吸道，使寄生的细菌乘机作乱，造成慢性炎症。中医又将普通感冒分为风寒、风热和暑湿三种类型。
二、传播途径和范围不同。两种感冒除都由空气飞沫传播外，近年来医学界认为，流感还可通过手接触传播。传播范围，普通感冒多为散发型。而流感则发病急、流行广、传播快，能跨地域大流行。
三、症状不同。感冒和流行性感冒，都有不同程度的全身中毒症状和上呼吸道感染症状。普通感冒，发热、畏寒，体痛以及头痛等全身症状，往往表现得较轻；而以鼻塞、流涕、咽喉干燥等上呼吸道感染症状表现得较为突出。流感、鼻塞、流涕等症状较轻；而畏寒、高热、全身痛、头痛等全身症状较重，且常并发肺炎、病毒性心肌炎等。
四、治疗方法不同。病毒与细菌是两种不同的病原微生物。由病毒引起的感冒用抗生素等消炎药根本无效，以采用中药治疗为宜，多以清瘟解毒、发汗为主，如银翘解毒丸、桑菊感冒片、板蓝根冲剂等；普通感冒则以清里解表为主，轻者可用生姜红糖汤，重者可用速效伤风胶囊丸、通宣理肺丸、伤风通圣丸等。如有合并细菌感染者可选用抗生素治疗。同时要注意休息，多饮白开水，适当增加营养。
五、免疫和预后不同。普通感冒一般一周左右即可痊愈，但所获得免疫力维持时间较短，因为能引起感冒的病毒上百种，类型多，能交叉感染而能交叉免疫，因此有的人在短时间内往往多次感冒。而患流感后，一般免疫可维持8—12个月。但其中的甲型流感病毒，易发生变异，每隔3—4年可引起小流行，每隔10—15年当变异出现新型时，就可引起大流行。因此，对流感的预防工作应广泛引起重视。
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