侵人生殖器的病原体有许多，有的是致病菌，如：大肠杆菌、乙类链球菌、葡萄球菌、结核杆菌等。有的是原虫，如：滴虫及阿米巴，有的是霉菌，有的是病毒。但主要是由细菌感染引起的。这些病原体可以通过不同的方式造成生殖器炎症。
生殖器的上行性感染是很常见的一种疾病。即病原体侵入外阴、阴道经宫颈到达子宫内膜、输卵管内膜可以到达卵巢及腹腔、病原体可以通过性交、不洁的阴道检查、经期卫生不良等多种方式带入。如公共卫生不良，通过盆浴或游泳等感染滴虫性阴道炎。通过性交传染梅毒、淋病等性病。中期引产放置导管或水囊过久；分娩过程中多次阴道检查都可把病原体直接带入，引起生殖器炎症。
病原体也可经过淋巴系统直接蔓延，分娩时外阴、阴道的损伤，胎盘剥离的巨大创面，在损伤的部位，淋巴管开放，病原体可乘机而人，沿淋巴管走行，使感染扩散。产后感染多是通过这一途径发生的。
经血液循环，病原体亦可造成生殖器的炎症。盆腔结核主要通过一方式传染的。一般结核菌最易通过呼吸道传染侵入到肺。在全身抵抗力低下时，结核菌通过血行播散，在生殖器输卵管是结核的易发部位，通过输卵管又可扩散到子宫，造成生殖器结核。
有时通过直接蔓延的方式也可引起生殖器炎症，如急性阑尾炎，通过直接蔓延引起输卵管炎。
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