早治肛瘘的意义在于，一可以防止肛瘘癌变，二可以减少局部反复化脓形成多个瘘道而增加治疗的难度，三可减轻痛苦，保护肛门功能不受影响。
肛瘘长期不愈是有可能癌变的，近年来临床这样的例子并不少见。肛瘘癌变后，由于其位于肛门部位，手术治疗一般很难保留肛门。因此为了防止肛瘘癌变，唯一的办法就是尽早治疗肛瘘。
绝大多数肛瘘开始都为单纯性，随着病情的反复发作，一是变成多瘘管的复杂性肛瘘，另一是向深部发展变成高位肛瘘，就会给手术增加难度。
随着肛瘘瘘管的增多和位置的向上，不仅肛周的瘢痕较重，手术时还必须切断肛门和直肠外的肌环才能达到治愈目的，这样不仅痛苦较大，愈合时间长，最主要的是肛门功能将受到影响，导致不同程度的肛门失禁。
因此，建议患者在明确患肛瘘后，应尽可能早地去正规的有专科的医院去接受手术治疗，不要存任何侥幸心理。
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