从母体带来的病称为先天性疾病，如兔唇、腭裂、多指(趾)等。肛门部也有先天性疾病，如肛门闭锁、肛门移位、肛门狭窄等等，以先天性肛门闭锁为多见。
1．原因
胎儿在母亲子宫里只有8毫米大的时候，胎儿的直肠和膀胱是互相通连的，这个沟通的地方称为肛腔。胎儿长到第七周时，肛腔分为前后两部，前面发育成泌尿生殖系统(膀胱、尿道、阴道)，后面向会阴部伸展发育形成直肠。从这时候起，直肠和膀胱就成为两个独立的、互不通连的脏器。胚胎第九周时，肛门部的肛膜消失，就逐渐形成了肛门。当胚胎在第七、八周时，如遇到各种各样的原因，引起胚胎发育异常，或发育中止时，就可以造成肛门直肠的畸形。
2．分类 据统计每5000个新生儿中就有一个肛门畸形的婴儿，它的种类很多，有时也很错综复杂。一般将分为以下类型。
第一型：肛门或直肠狭窄。肛门和直肠都完整而且相通，只是肛门或直肠下端狭窄，管径比正常婴儿细，粪便通过发生困难。
第二型：肛门膜状闭锁。直肠正常，肛门部有凹陷，肛门与直肠之间有膜状隔阻塞，引起肛门与直肠不相通而大便不得排出。
第三型：肛门直肠闭锁。直肠下段与肛门皮肤凹陷之间有相当距离，不能大便和排气，这种畸形最多见，约占整个肛门直肠先天性畸形的一半以上。
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