睾丸炎轻者迁延日久，疼痛较轻、泛化，具有放射性疼，所以不容易判断炎症的确切部位。睾丸的疼痛不一定与炎症的轻重程度成正比，有些人的神经敏感程度很高，轻度炎症就可引起较严重的疼痛感;而有些人比较迟缓，自我感觉就轻。
有的疼痛发生在性生活之后，这可能由于性兴奋使生殖器和生殖腺高度充血所致。有的疼痛系精索精脉曲张或其他部位的疼痛放射而来，如输尿管结石引起的睾丸放射性疼痛，这时就要仔细鉴别真正的原因以便有效的对症处理。
肿胀的睾丸内部充血、出血，分泌精子的腺细胞肿胀、变性，部分坏死。约持续4天左右睾丸肿痛等症状减轻，体温逐渐恢复正常，几周后约有30%~40%的患者有睾丸萎缩，如双侧睾丸都萎缩则失去生精功能，以致终身不育。
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