再障的发病不外乎与感染、射线、免疫等内外因素有关，其发病机制目前公认的是造血干细胞缺乏或缺陷、造血微环境障碍和免疫异常，而免疫介导的造血抑制是再障最常见的病理机制。
1、 造血干细胞缺乏或缺陷，一般形象的称为种子：干细胞减少或/和质的异常，不能分化、增殖，再障患者红细胞集落形成单位(cfu-e)对红细胞生成素不反应，或合成血红素能力低于正常。血中的粒单系祖细胞集落(cfu-c)低于正常，cfu-c越少，再障病情越重。
2、 造血微环境障碍，被称为土壤：骨髓的微环境包括微循环和基质，骨髓造血和骨髓微环境有密切关系。再障骨髓切片可见毛细血管较少，血流量降低，间质有水肿，造血微环境有病变。骨髓细胞生长需要骨髓基质细胞和细胞外基质构成的网络，为造血干细胞提供适宜的生长环境。
3、 免疫异常，被称为虫子：40%~70%的再障患者免疫异常，抑制造血。t细胞异常，活性增高;造血负调控因子增加;巨噬细胞、淋巴细胞对cfu-c、cfu-e有抑制作用。
国医再障科研组根据祖国医学五脏的生、克、侮的传化以及西医科学理论，集各家所长，上不泥与古法，下不拘于成方，在一定程度上革旧创新。理论创新，在实践中依据治疗血液病的“活性植物清髓疗法”理论，同时依据《皇帝内经》、《医宗金鉴》、东医宝剑》的阴静阳动、阳化气、阴成形;味归形，形归气;气归精，精归化;精食气，形食味;化生精，气生形;味伤形，气伤精;精化为气，气伤于味等。掌握精、气、神、血、津液的生成变化，排除后天各种致病因素，归纳和创立了“五步清髓培壤法”。
第一步：清理排毒期(一般指前两个疗程用药)
运用独创的活性植物药中的有效活性因子，刺激干细胞的生成，并且有效促使血中cfu-c的增加、cfu-e合成血红素能力提升，进行清理排泄致病毒素，使其通过大、小便排出体外。此期多采用具有益阴清热，凉血止血等功效的药物治疗。用药后一般患者腹胀、失眠、乏力、头晕有所好转，平均服药3~4个月，此期发烧出血已得到基本控制。“种子”得到优化。
第二步：调理治疗期(一般需要两个疗程)
运用独创的活性植物药特有的“活性理血因子”对骨髓微环境和基质进行调理，可见骨髓中毛细血管增加，血流量增强，间质水肿消失，并且全面促使基质细胞的形成，为骨髓细胞提供良好的生长环境。造血微环境得到改善，造血功能开始恢复。患者常表现为气色好转、脸色红润、外周血象回升。“土壤”得到改良。
第三步：功能恢复期(一般要三至四个疗程用药)
经过以上两个时期的治疗，病毒基本排除，活性植物药独有的“活性免疫因子”分布全身，对沉睡的免疫系统进行激活，降低t细胞活性，造血负调控因子减少，巨噬细胞、淋巴细胞活性提高，使其充分发挥其免疫、调节功能，防御致病因素再次侵袭，骨髓活检可见骨髓造血岛开始增多、活跃。脉络畅通，阴阳平横，脏腑之间的生、克、侮的转化正常。“虫子”得以清除。
此时，输血的病人渐渐延长输血时间或已脱离输血，慢性患者皮肤由焦、粗糙开始转化为细嫩有光泽，皮肤光泽从鼻尖部开始，随即是上额，然后从前臂指尖部开始向肩部，再向下肢腿部，患者自觉有精神，有力气。此为上、中、下三焦已通，脏腑功能已恢复。此期的治疗以平补阴阳，补气健脾，生血为主。
第四步：生髓益阳期(治疗间断用药)
此期以生髓补阳为主，常效果明显，是各种血细胞上升快的时期，患者不适症状基本消失，面色如同常人，红润而有光泽，血红蛋白在100g/l，白细胞在4.0×109/l，血小板80×109/l以上，骨髓增生变为活跃。此时可带药出院巩固治疗，如遇出现血象上下波动不稳，仍需用药调治。机体得以全面补益。
第五步：巩固期
此期各种血细胞升到正常值范围后，再调治4~6个月为巩固期。如遇感冒发烧，不在复发。但要防止受大寒，以免导致二次复发。患者得以康复。
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