体外冲击波虽然安全有效，但有时在治疗中或治疗后也会出现一些副反应，一般不严重。其并发症及处理方法如下：
血尿：体外冲击波仲石术后，几乎所有病人都会出现程度不同的血尿，以肾结石多见。血尿的产生是在碎石过程中结石与周围组织粘膜摩擦引起粘膜破损，结石碎片在排出移动时轻微划破粘膜，还有冲击波引起的水肿出血等原因引起。一般血尿较轻、血色淡红，不需特殊治疗，l一2天即可自行缓解和消失。
绞痛：多见于肾结石，多较轻，经给予解痉止痛药对症治疗均可缓解。如肾结石过大，碎石后出现输尿管碎石堆积梗阻输尿管，可采用对碎石堆积处再次碎石。
发热：多内于尿路感染未加控制而碎石引起，或由于碎石堆积尿路梗阻所致，应给予抗生素治疗，必要时作细菌培养及药敏试验而选用抗生素。
输尿管内碎石堆积(石街)：这是因较大结石行碎石治疗后较常出现的问题。如碎石后出现输尿管内结石堆积引起梗阻，可采用碎石堆积处行体外冲击波碎石以解除梗阻，必要时输尿管镜取石。
便血：如治疗时胃肠道积气过多，冲击波损伤消化道粘膜会引起肠壁出血。一般出血轻微，可不需特殊治疗即可自愈。在治疗前做好肠道清洁准备，减少肠道积气，可以避免损伤。
肾实质损害：一般肾损害轻微，可很快恢复，不留瘢痕。
结石复发：多由于致结石因素未去除，或留下部分残余结石未完全排尽，以及碎石嵌顿于粘膜所致。防治办法以预防为主。
我们发挥祖国中医医学的优势，在碎石术后使用中药排石治疗使结石碎片尽快排出，减少输尿管内碎石堆积而引起输尿管梗阻等并发症。
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