1.流感样症候群：表现为发热、寒战、头痛、肌肉酸痛、乏力等，可在睡前注射ifnα，或在注射ifnα同时服用非甾体类消炎镇痛药，以减轻流感样症状。随疗程进展，此类症状逐渐减轻或消失。
2.骨髓抑制：一过性骨髓抑制主要表现为外周血白细胞和血小板减少。1～2周后复查，如恢复，则逐渐增加至原量，则应停药。对于中性粒细胞明显降低者，可用粒细胞集落刺激因子或粒细胞巨噬细胞集落刺激因子治疗。
3.精神异常：可表现为抑郁、妄想症、重度焦虑和精神病。其中抑郁是ifnα治疗过程中常见的不良反应，症状可从烦躁不安到严重的抑郁症。因此，使用ifnα前应评估患者的精神状况，治疗过程中也要密切观察。抗抑郁药可缓解此类不良反应。对症状严重者，应及时停用ifnα。
4.ifnα可诱导自身抗体的产生：包括抗甲状腺抗体、抗核抗体和抗胰岛素抗体。多数情况下无明显临床表现，部分患者可出现甲状腺疾病(甲状腺功能减退或亢进)、糖尿病、血小板减少、溶血性贫血、银屑病、白斑、类风湿性关节炎和系统性红斑狼疮样综合征等，严重者应停药。
5.其他少见的不良反应：包括肾脏损害(间质性肾炎、肾病综合征和急性肾衰竭等)、心血管并发症(心律失常、缺血性心脏病和心肌病等)、视网膜病变、听力下降和间质性肺炎等，发生上述反应时，应停止治疗。
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